Tip:
Highlight text to annotate it
X
Virtual NanoLab'a hoşgeldiniz.
Ben Nanna. Bu videoda sizlere Quantumwise'ın ürünü olan
Virtual NanoLab ortamında molbidenyum disülfid
nanotüpün oluşturulmasını anlatacağım.
Virtual Nanolab ortamında bir karbon nanotüpün oluşturulması
kolay ancak molbidenyum disülfid gibi daha karmaşık
bir nanotüp oluşturmak istediğinizde
nasıl yapacaksınız?
Böyle bir amaç için Quantumwise "Tubewrapper" isminde bir araç geliştirdi.
Bu videoda size zigzag molbidenyum disülfid bir nanotüpün
oluşturulmasından bahsedeceğim.
Burada kullanacağımız yöntem, başka tür metal-sülfid
nanotüplerin oluşturulmasında da kullanılabilir.
Örnek yapılar için bu videonun tanımında verilen bilimsel referanslara bakabilirsiniz.
Başlayalım...
Virtual NanoLab'ı açıyoruz.
"Help" menüsü altındaki "AddOn Manager"ı açıyoruz.
"TubeWrapper"ı bulmak için aşağı kaydırıyoruz...
Bu eklentiyi kuruyoruz.
Kurulumdan sonra eklentiyi kullanmak için
Virtual NanoLab'ı yeniden başlatmanız gerekir.
"Builder" modülünü açıyoruz.
"Stash"e gidin.
"Add from Database"i seçiyoruz.
Buradan molbidenyum
disülfidi bulup
"Stash" penceresine ekliyoruz.
Öncelikle sağdaki tabakayı silmeniz gerekecek.
Hücrede sağ taraftaki üç atomu seçip
"Delete" tuşuna basarak siliyoruz.
Bu şekilde tek tabaka halinde molbidenyum kalacaktır.
Bu altıgen bir hücre.
Ancak nanotüp oluşturmak için ortorombik bir
hücre elde etmemiz gerekir.
Bu nedenle
"Bulk Tools"u açıyoruz.
"Supercell" kısmından
A' değerini
2'ye
B değerini de 1'e ayarlayıp
"Transform" tuşuna basıyoruz.
Böylece ortorombil bir hücre elde ettik.
Bu hücreyi nanotüpe kıvırmak için daha uzun bir yapı lazım dolayısıyla
yapıyı tekrarlıyoruz.
Bunun için "Bulk Tools"u açıyoruz.
"Repeat" kısmından
20 gibi orta karar bir sayıya ayarlıyoruz.
Tekrarlanan yöndeki uzunluk
nanotüpün çevresini belirleyecek.
B yönünde 20 kez tekrarlıyoruz.
"Apply" tuşuna basıyoruz.
Daha sonra "Bulk Tools"dan
kafes parametrelerini ayarlıyoruz.
Kartezyen koordinat sisteminde kalarak
A değerini
65 olarak
değiştiriyoruz.
"Enter" tuşuna basıyoruz.
Şimdi "Coordinate Tools" menüsünden
"Center" kısmından
sistemi sadece
A yönünde ortalıyoruz ve
Apply'ı tıklıyoruz.
Şimdi görünümü
Ctrl+R kombinasyonuyla ortalayabiliriz.
Son olarak da yüklediğimiz eklentiyi bulalım.
"Coordinate Tools"dan
"Tubewrapper"ı
seçiyoruz.
Tam olarak kıvrılmış bir nanotüp için
360 dereceyi seçiyoruz.
Başka türlü bir yapı için de istediğiniz bir açıyı seçebilirsiniz. "Apply tuşuna basıyoruz."
Şimdi de hücre boyutunu
ayarlayacağız.
Daha sonra da sistemi A ve B'de ortalayacağız.
Bunu "Bulk Tools"daki
"Lattice Parameters"dan yapıyoruz.
x değerini mesela
40'a, b değerini de
aynı sayıya ayarlayalım.
En son olarak da "Coordinate Tools"daki
"Center" kısmından
B ve C'yi seçip
Apply'ı tıklıyoruz.
Böylece bir molbidenyum disülfid
nanotüp elde etmiş olduk.
Bu yapı üzerinde şimdi çeşitli
çeşitli hesaplamalar yapabilirsiniz.
Umarım bu videoyu yararlı bulmuşsunuzdur.
İzlediğiniz için teşekkürler...